More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3391 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  77.35 
 
 		 233 aa  367  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  77.78 
 
 		 233 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  69.66 
 
 		 235 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  66.52 
 
 		 234 aa  319  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  67.38 
 
 		 239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  65.67 
 
 		 235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  64.81 
 
 		 234 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.81 
 
 		 234 aa  308  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  63.95 
 
 		 235 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  63.09 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  60.94 
 
 		 236 aa  297  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  60.94 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  60.26 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  62.39 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  62.23 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  55.98 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  61.8 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  59.4 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  58.37 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  58.12 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  58.8 
 
 		 236 aa  288  7e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 238 aa  286  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.52 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  60.94 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  55.56 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  61.37 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.13 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  59.83 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.13 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.13 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.13 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.13 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  58.55 
 
 		 236 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  59.4 
 
 		 238 aa  284  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  59.66 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  59.83 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  59.4 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  59.4 
 
 		 235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  59.23 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  55.13 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  60.52 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  54.7 
 
 		 238 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  54.27 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  54.27 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  58.12 
 
 		 235 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  59 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  58.37 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  54.27 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  57.51 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.51 
 
 		 234 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  55.98 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  57.08 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  60.52 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.85 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  57.74 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 247 aa  275  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  56.3 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  57.51 
 
 		 234 aa  275  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  54.94 
 
 		 234 aa  274  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.99 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  56.65 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  56.22 
 
 		 237 aa  271  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  52.99 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  56.65 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 236 aa  271  9e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  54.7 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  58.55 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  57.08 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  57.08 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  55.13 
 
 		 239 aa  269  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.89 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  55.13 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  57.08 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  58.3 
 
 		 258 aa  268  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  55.79 
 
 		 260 aa  268  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  57.45 
 
 		 256 aa  268  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  54.7 
 
 		 265 aa  268  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  55.32 
 
 		 239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 		 237 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>