More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4943 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  99.57 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  99.14 
 
 		 233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  99.57 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  98.71 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  98.28 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  91.85 
 
 		 233 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  90.13 
 
 		 233 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  89.7 
 
 		 233 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  89.7 
 
 		 233 aa  427  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  90.13 
 
 		 233 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  83.26 
 
 		 233 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  74.57 
 
 		 236 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  74.57 
 
 		 237 aa  358  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  74.57 
 
 		 237 aa  358  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  72.53 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  67.38 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.95 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.95 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.95 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.95 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.95 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.52 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.09 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  65.24 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.24 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.24 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  65.24 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  65.24 
 
 		 237 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.24 
 
 		 237 aa  321  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.24 
 
 		 241 aa  321  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.24 
 
 		 233 aa  321  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.24 
 
 		 237 aa  320  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 		 233 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 		 233 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  65.67 
 
 		 233 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  66.52 
 
 		 233 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  64.81 
 
 		 233 aa  317  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  64.38 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  61.8 
 
 		 233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0232  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  67.38 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.8 
 
 		 233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  64.96 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  64.38 
 
 		 233 aa  300  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  64.38 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  61.11 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.4 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  57.94 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  62.23 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  287  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  62.23 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  58.12 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.8 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  59.4 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  61.8 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  61.8 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  58.97 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  57.69 
 
 		 247 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  57.69 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 235 aa  279  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.98 
 
 		 238 aa  277  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  58.9 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  56.41 
 
 		 236 aa  275  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  58.9 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  54.51 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  58.12 
 
 		 245 aa  274  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  59.83 
 
 		 265 aa  274  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 294 aa  274  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  55.98 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  55.13 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.98 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.56 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  57.33 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.47 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  56.22 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  54.51 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  54.51 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.13 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  57.69 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  55.36 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.99 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  55.93 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  54.08 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  54.08 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  56.36 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  53.65 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.65 
 
 		 239 aa  265  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 234 aa  265  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  57.33 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  54.7 
 
 		 243 aa  264  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  56.36 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  54.51 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>