More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1244 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  93.56 
 
 		 233 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  93.13 
 
 		 233 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  93.99 
 
 		 233 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  93.56 
 
 		 233 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  93.99 
 
 		 233 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  93.99 
 
 		 233 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  86.7 
 
 		 233 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  86.7 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  79.4 
 
 		 233 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  84.55 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.96 
 
 		 237 aa  338  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.1 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.1 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.1 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.1 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.1 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.1 
 
 		 233 aa  334  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  69.1 
 
 		 233 aa  333  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 233 aa  333  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  68.67 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  68.67 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 233 aa  332  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  68.67 
 
 		 237 aa  332  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 233 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 233 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 233 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.67 
 
 		 233 aa  332  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.24 
 
 		 237 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  68.24 
 
 		 233 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  67.67 
 
 		 237 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  67.67 
 
 		 237 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0232  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  66.09 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  62.23 
 
 		 233 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  62.66 
 
 		 233 aa  308  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  62.23 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  62.23 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 		 233 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  62.23 
 
 		 233 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  62.23 
 
 		 233 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.23 
 
 		 233 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  61.8 
 
 		 233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  62.23 
 
 		 233 aa  305  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  68.24 
 
 		 233 aa  305  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.37 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  61.8 
 
 		 233 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  60.94 
 
 		 233 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  62.39 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  58.97 
 
 		 257 aa  285  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.26 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  60.68 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  58.55 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  60.26 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  58.97 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  57.69 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  58.12 
 
 		 247 aa  277  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  58.12 
 
 		 240 aa  277  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  57.69 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  58.8 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.9 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  58.37 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  55.56 
 
 		 245 aa  274  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  58.9 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.97 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.12 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  58.37 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  58.37 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  58.12 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  57.51 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  56.65 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  55.79 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  57.51 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  58.55 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  59.07 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 234 aa  268  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  57.2 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 238 aa  267  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  57.2 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  57.08 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.98 
 
 		 234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  57.63 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 238 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  55.79 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  52.59 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  54.31 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  55.6 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  55.79 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  59.66 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.85 
 
 		 235 aa  257  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  55.08 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  52.16 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>