More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3664 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  99.57 
 
 
233 aa  470  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  91.85 
 
 
233 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  91.42 
 
 
233 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  91.85 
 
 
233 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  89.7 
 
 
233 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  86.7 
 
 
237 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  87.12 
 
 
237 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  86.7 
 
 
237 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  86.7 
 
 
237 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  87.12 
 
 
237 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  86.7 
 
 
233 aa  417  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  86.7 
 
 
237 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  86.27 
 
 
237 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0232  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  91.85 
 
 
233 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  86.27 
 
 
241 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  85.84 
 
 
237 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  85.84 
 
 
237 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  85.84 
 
 
233 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  85.84 
 
 
237 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  85.84 
 
 
237 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  85.84 
 
 
237 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  72.53 
 
 
233 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  72.53 
 
 
233 aa  331  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  67.81 
 
 
233 aa  328  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  69.53 
 
 
233 aa  327  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.81 
 
 
233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  65.67 
 
 
233 aa  321  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  66.38 
 
 
236 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  65.67 
 
 
233 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  65.67 
 
 
233 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  65.67 
 
 
233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  65.67 
 
 
233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  65.67 
 
 
233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  72.1 
 
 
233 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  67.24 
 
 
237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  67.24 
 
 
237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  65.24 
 
 
233 aa  318  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  64.81 
 
 
233 aa  317  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 
233 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  65.24 
 
 
233 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.96 
 
 
233 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.38 
 
 
233 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  69.96 
 
 
233 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  69.96 
 
 
233 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  65.67 
 
 
233 aa  314  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  69.53 
 
 
233 aa  314  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  64.81 
 
 
233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  68.67 
 
 
233 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  67.81 
 
 
233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  61.54 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.94 
 
 
238 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  62.82 
 
 
238 aa  281  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.94 
 
 
238 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  61.37 
 
 
238 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  60.94 
 
 
238 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  60.26 
 
 
257 aa  278  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  60.52 
 
 
238 aa  277  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  60.52 
 
 
238 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  60.26 
 
 
244 aa  275  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  60.09 
 
 
238 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  59.66 
 
 
234 aa  272  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  57.94 
 
 
237 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  56.84 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  60.52 
 
 
238 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  58.12 
 
 
241 aa  266  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.98 
 
 
236 aa  266  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  56.41 
 
 
234 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.41 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  57.94 
 
 
238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  55.98 
 
 
247 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  59.4 
 
 
265 aa  264  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  61.02 
 
 
244 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  56.3 
 
 
247 aa  262  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  60.17 
 
 
246 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  57.69 
 
 
235 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  58.97 
 
 
258 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  59.4 
 
 
258 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 
248 aa  258  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  57.69 
 
 
245 aa  258  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  58.9 
 
 
244 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  54.7 
 
 
236 aa  258  7e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.27 
 
 
237 aa  257  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  56.41 
 
 
248 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 
243 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
247 aa  255  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  60.94 
 
 
234 aa  255  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.99 
 
 
234 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  55.04 
 
 
247 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  54.94 
 
 
233 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  55.13 
 
 
243 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  58.9 
 
 
246 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  53.65 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  54.31 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  53.78 
 
 
247 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>