More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1383 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  84.55 
 
 		 233 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  84.55 
 
 		 233 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  79.83 
 
 		 233 aa  381  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  84.55 
 
 		 233 aa  377  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  84.12 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  84.12 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  84.12 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  84.12 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  83.26 
 
 		 233 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  83.26 
 
 		 233 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  72.96 
 
 		 237 aa  350  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  71.67 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 233 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  71.67 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.67 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.67 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  71.67 
 
 		 237 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.67 
 
 		 233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.67 
 
 		 233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.67 
 
 		 237 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 241 aa  341  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  72.1 
 
 		 233 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.67 
 
 		 233 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  72.1 
 
 		 233 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  72.1 
 
 		 233 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  71.24 
 
 		 233 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  70.82 
 
 		 233 aa  337  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0232  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  72.53 
 
 		 233 aa  321  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 		 233 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 		 233 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  64.81 
 
 		 233 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.38 
 
 		 233 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  64.66 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  64.66 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  307  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  63.95 
 
 		 233 aa  307  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  63.52 
 
 		 236 aa  307  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  63.09 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  63.52 
 
 		 233 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  69.1 
 
 		 233 aa  301  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  62.39 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  61.97 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  61.54 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  61.54 
 
 		 265 aa  279  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  59.83 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  61.44 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  62.29 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.4 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  61.02 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  59.83 
 
 		 236 aa  275  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  60.68 
 
 		 234 aa  275  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  59.83 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  58.12 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  59.75 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  58.55 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  60.17 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  60.09 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  58.55 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 238 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  59.83 
 
 		 238 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  57.69 
 
 		 247 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  59.23 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.69 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  59.4 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  59.75 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  56.41 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  58.05 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  59.4 
 
 		 238 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  56.22 
 
 		 233 aa  266  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.97 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  58.55 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  57.51 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  58.12 
 
 		 294 aa  263  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  56.65 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.12 
 
 		 238 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  58.12 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  57.69 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  57.69 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  57.76 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.56 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.56 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  55.6 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>