More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1743 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  94.19 
 
 		 258 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  78.78 
 
 		 265 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  76.65 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  77.82 
 
 		 245 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.68 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  73.28 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  74.37 
 
 		 247 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  75.31 
 
 		 244 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  74.06 
 
 		 241 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  73.84 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  71.95 
 
 		 247 aa  353  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  74.06 
 
 		 244 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  69.92 
 
 		 240 aa  349  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  71.37 
 
 		 247 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  71.31 
 
 		 243 aa  348  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 		 243 aa  347  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  71.78 
 
 		 244 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  68.95 
 
 		 294 aa  343  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  71.67 
 
 		 246 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  70 
 
 		 246 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  63.4 
 
 		 238 aa  305  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.98 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  63.98 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  63.83 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  65.25 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  62.71 
 
 		 238 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  63.56 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  64.1 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  64.53 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  64.1 
 
 		 234 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  63.4 
 
 		 238 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.98 
 
 		 238 aa  294  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  62.13 
 
 		 238 aa  291  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  58.97 
 
 		 233 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.97 
 
 		 233 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 233 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  63.25 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  59.4 
 
 		 233 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  58.55 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.97 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  58.97 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  59.4 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  58.12 
 
 		 233 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  57.69 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  57.51 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  57.51 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  61.6 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.69 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  57.69 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  57.09 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  57.69 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  57.69 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  58.37 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  58.55 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  58.62 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  62.39 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  56.47 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  57.26 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  57.26 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  57.26 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  57.69 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  59.83 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.97 
 
 		 233 aa  265  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  57.51 
 
 		 235 aa  265  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  57.08 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  55.74 
 
 		 234 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  56.65 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.97 
 
 		 233 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.04 
 
 		 238 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  58.97 
 
 		 233 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  59.05 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  58.97 
 
 		 233 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  58.97 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  56.22 
 
 		 238 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  56.22 
 
 		 238 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  57.63 
 
 		 237 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.97 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.12 
 
 		 233 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.97 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  56.17 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  56.22 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.97 
 
 		 233 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  58.37 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.04 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  55.98 
 
 		 233 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  53.62 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>