More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5535 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  78.45 
 
 
238 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  76.82 
 
 
256 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  78.97 
 
 
245 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  66.81 
 
 
239 aa  322  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  65.68 
 
 
247 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  65.81 
 
 
236 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  65.68 
 
 
247 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  65.68 
 
 
247 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  64.53 
 
 
236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  65.25 
 
 
251 aa  307  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  62.98 
 
 
239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  63.98 
 
 
247 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  63.14 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  64.96 
 
 
235 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  63.52 
 
 
237 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  61.9 
 
 
235 aa  292  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  61.54 
 
 
239 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  61.21 
 
 
233 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  62.77 
 
 
258 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  60.78 
 
 
233 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  62.66 
 
 
233 aa  286  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  60.68 
 
 
235 aa  284  7e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.66 
 
 
234 aa  284  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  57.69 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  57.51 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.68 
 
 
234 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  58.8 
 
 
235 aa  281  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  61.28 
 
 
234 aa  280  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  60.68 
 
 
238 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  60.43 
 
 
235 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.87 
 
 
235 aa  277  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  58.12 
 
 
234 aa  275  6e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  60.59 
 
 
265 aa  274  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 
233 aa  274  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  56.84 
 
 
236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  56.22 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 
233 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  56.84 
 
 
239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  58.19 
 
 
237 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  58.97 
 
 
236 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.16 
 
 
241 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  57.94 
 
 
236 aa  271  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  57.26 
 
 
234 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  57.56 
 
 
241 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  55.79 
 
 
234 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  57.56 
 
 
241 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  56.22 
 
 
233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  59.23 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  55.13 
 
 
234 aa  268  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  58.12 
 
 
240 aa  268  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  55.56 
 
 
234 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  57.45 
 
 
237 aa  268  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  55.79 
 
 
233 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  56.17 
 
 
235 aa  268  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  56.65 
 
 
233 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  54.47 
 
 
237 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.56 
 
 
239 aa  267  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  56.22 
 
 
241 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
234 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  55.36 
 
 
236 aa  266  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  55.32 
 
 
238 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  57.69 
 
 
258 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  55.79 
 
 
233 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  58.37 
 
 
237 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 
247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 
233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 
242 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  57.94 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  55.79 
 
 
233 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  55.79 
 
 
233 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  57.26 
 
 
258 aa  263  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  52.79 
 
 
238 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 
238 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.84 
 
 
236 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  55.46 
 
 
247 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.36 
 
 
233 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  56.65 
 
 
264 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  59.23 
 
 
234 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 
238 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  56.47 
 
 
242 aa  262  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  57.33 
 
 
249 aa  262  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  55.36 
 
 
233 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  56.22 
 
 
236 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  55.36 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  55.36 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  56.41 
 
 
237 aa  262  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
237 aa  262  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  56.9 
 
 
233 aa  261  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  57.26 
 
 
236 aa  261  6e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  57.02 
 
 
236 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.99 
 
 
238 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.99 
 
 
238 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  55.79 
 
 
235 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  54.08 
 
 
437 aa  261  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
247 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  54.7 
 
 
242 aa  260  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  59.74 
 
 
237 aa  260  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  54.7 
 
 
242 aa  260  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  54.51 
 
 
238 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>