More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2654 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  83.83 
 
 
235 aa  400  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  67.23 
 
 
237 aa  316  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  66.81 
 
 
237 aa  314  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  62.98 
 
 
256 aa  308  6.999999999999999e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  65.82 
 
 
238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  63.52 
 
 
235 aa  304  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  63.52 
 
 
235 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  62.55 
 
 
235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.82 
 
 
234 aa  301  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  62.82 
 
 
235 aa  301  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  62.23 
 
 
235 aa  299  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  61.37 
 
 
259 aa  296  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  60.26 
 
 
239 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  58.97 
 
 
234 aa  294  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  60.43 
 
 
235 aa  294  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  60.43 
 
 
236 aa  293  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  64.53 
 
 
258 aa  291  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  60.68 
 
 
234 aa  289  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  56.84 
 
 
238 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  58.65 
 
 
237 aa  285  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  61.8 
 
 
238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  62.55 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  55.08 
 
 
237 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  60.52 
 
 
234 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  53.85 
 
 
234 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  59.83 
 
 
233 aa  278  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  59.23 
 
 
239 aa  277  8e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  61.54 
 
 
245 aa  277  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  56.78 
 
 
236 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  57.02 
 
 
237 aa  277  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  60.08 
 
 
240 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  58.8 
 
 
239 aa  276  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  60 
 
 
244 aa  275  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  59.66 
 
 
247 aa  275  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
236 aa  272  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  56.78 
 
 
236 aa  272  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  54.27 
 
 
238 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  56.41 
 
 
234 aa  271  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  54.94 
 
 
235 aa  271  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  57.51 
 
 
236 aa  271  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  54.47 
 
 
236 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  57.51 
 
 
242 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  58.37 
 
 
234 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  55.56 
 
 
238 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  57.81 
 
 
239 aa  269  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  55.36 
 
 
237 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  59.66 
 
 
234 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  57.08 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  58.55 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  59.24 
 
 
265 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  57.45 
 
 
234 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  56.84 
 
 
234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 
234 aa  268  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  59.23 
 
 
234 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  56.84 
 
 
242 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  53.81 
 
 
239 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  59.23 
 
 
236 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  59.32 
 
 
247 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  58.8 
 
 
236 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
233 aa  265  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  59.15 
 
 
247 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  56.6 
 
 
234 aa  265  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  56.22 
 
 
245 aa  265  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  60.17 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.9 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  55.79 
 
 
238 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 
235 aa  263  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
235 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  55.04 
 
 
247 aa  262  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  57.08 
 
 
233 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  57.63 
 
 
258 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
236 aa  260  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  56.6 
 
 
237 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.88 
 
 
247 aa  260  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.15 
 
 
243 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  55.79 
 
 
234 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  53.22 
 
 
238 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  52.14 
 
 
237 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  53.22 
 
 
238 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  56.6 
 
 
237 aa  258  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  55.27 
 
 
240 aa  258  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  54.66 
 
 
237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  58.47 
 
 
241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  55.46 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  56.78 
 
 
257 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.27 
 
 
234 aa  257  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  52.99 
 
 
238 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  52.99 
 
 
238 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.99 
 
 
238 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 
238 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  53.75 
 
 
240 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 
244 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  51.5 
 
 
238 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  53.22 
 
 
237 aa  255  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  57.38 
 
 
294 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  52.99 
 
 
234 aa  255  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.34 
 
 
237 aa  255  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>