More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1726 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  85.23 
 
 		 237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  64.68 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  64.68 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  63.4 
 
 		 238 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.98 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  62.55 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  59.32 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  60.26 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  63.83 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  63.56 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  63.14 
 
 		 238 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  59.75 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  63.4 
 
 		 264 aa  300  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  59.32 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.9 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  60.59 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.59 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  59.32 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  58.9 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  58.9 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  58.9 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  58.9 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  61.11 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  61.97 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  59.07 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  62.55 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  62.98 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  62.13 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  62.29 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  63.56 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  61.7 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  61.28 
 
 		 241 aa  286  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  58.8 
 
 		 234 aa  284  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  60.26 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2475  ABC transporter related  61.97 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  54.27 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  53.62 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  57.69 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  55.36 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.36 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  55.56 
 
 		 236 aa  267  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  56.22 
 
 		 249 aa  267  8.999999999999999e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  54.89 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.13 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  54.94 
 
 		 234 aa  264  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  55.56 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  54.08 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  54.47 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.08 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  55.08 
 
 		 237 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  54.51 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  53.22 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.79 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.71 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.08 
 
 		 239 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  53.85 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  53.42 
 
 		 236 aa  257  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  54.51 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  52.56 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.56 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50.43 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.49 
 
 		 256 aa  254  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.56 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  53.22 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  50.43 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.36 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  54.27 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.92 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.85 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  50.64 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.12 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.56 
 
 		 234 aa  248  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  51.91 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  51.07 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>