More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3093 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.74 
 
 
235 aa  272  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  60.43 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.85 
 
 
254 aa  271  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  60.43 
 
 
254 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  60 
 
 
254 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  60.94 
 
 
254 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.94 
 
 
262 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  54.27 
 
 
235 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  56.22 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.13 
 
 
238 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  53.65 
 
 
235 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
235 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
259 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  53.65 
 
 
234 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  55.36 
 
 
235 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  54.94 
 
 
237 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  53.65 
 
 
235 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.36 
 
 
235 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  54.51 
 
 
237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.68 
 
 
239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 
234 aa  252  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  50.85 
 
 
237 aa  251  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  54.51 
 
 
238 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
256 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  54.51 
 
 
245 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.91 
 
 
239 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  49.16 
 
 
264 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.32 
 
 
241 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.91 
 
 
239 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.79 
 
 
236 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  51.26 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.91 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  51.26 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  53.65 
 
 
233 aa  244  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  54.47 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  51.93 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.93 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  47.88 
 
 
238 aa  242  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
237 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.93 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.14 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.86 
 
 
236 aa  241  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.58 
 
 
237 aa  241  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  52.14 
 
 
258 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.51 
 
 
238 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  48.73 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  49.36 
 
 
238 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.95 
 
 
244 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
234 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.5 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
238 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  53.42 
 
 
242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  50 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.5 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.79 
 
 
236 aa  239  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  53.5 
 
 
266 aa  238  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 
238 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  48.72 
 
 
238 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  47.03 
 
 
242 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  45.57 
 
 
238 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  51.5 
 
 
233 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  51.07 
 
 
233 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  46.81 
 
 
237 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  49.36 
 
 
238 aa  237  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  51.28 
 
 
238 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 
234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  51.07 
 
 
258 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  50.21 
 
 
233 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  48.93 
 
 
234 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  49.36 
 
 
236 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.91 
 
 
258 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 
244 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50.64 
 
 
233 aa  235  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.5 
 
 
234 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.73 
 
 
238 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
238 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  49.57 
 
 
233 aa  235  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  54.89 
 
 
237 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  47.21 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
236 aa  234  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  46.15 
 
 
238 aa  234  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  52.36 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  48.09 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  46.15 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>