More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3586 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  97.64 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  96.84 
 
 		 254 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  96.41 
 
 		 254 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  94.44 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  74.9 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  60.43 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.32 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.64 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 235 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.85 
 
 		 235 aa  255  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  47.5 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.36 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  50.85 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  50.85 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.43 
 
 		 234 aa  251  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 237 aa  248  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.51 
 
 		 242 aa  248  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.36 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.37 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 		 238 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.78 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.5 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.86 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.46 
 
 		 237 aa  241  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50.85 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  51.93 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  48.1 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  49.57 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  50.63 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.93 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  51.07 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.07 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 237 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  50.64 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.52 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  50.64 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.35 
 
 		 235 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  51.49 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.15 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  49.79 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  47.01 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  49.15 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  47.68 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  234  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.36 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>