More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5638 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2144  ABC transporter related  57.56 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.58 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  52.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.97 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.31 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.15 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  50.21 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.58 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.57 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.27 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.23 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  50.21 
 
 		 254 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  50.21 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.27 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  50.21 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.71 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  51.71 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.28 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  44.44 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.26 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  46.38 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.94 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  45.76 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.96 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  53.56 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  47.86 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.68 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.86 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  51.91 
 
 		 234 aa  224  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  44.49 
 
 		 260 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45.76 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  51.28 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  48.75 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  53.62 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 244 aa  222  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3770  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  47.44 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3369  ABC transporter related  50.85 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.23 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  47.86 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  48.12 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  48.12 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  48.31 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  47.44 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  44.02 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  50.64 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  50.21 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 258 aa  218  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.64 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  49.58 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  44.54 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.85 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  51.9 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.96 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  49.79 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>