More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0145 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.7 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  55.74 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  53.19 
 
 		 240 aa  244  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  52.54 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  49.79 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.28 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.68 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  52.97 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.26 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  53.39 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  50.63 
 
 		 243 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  48.72 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  48.72 
 
 		 238 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  48.72 
 
 		 238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  48.72 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  53.62 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  48.72 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  48.72 
 
 		 238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.29 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  47.86 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  52.34 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  51.06 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  49.15 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.86 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  47.86 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  50.21 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  45.96 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  54.47 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  51.91 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.09 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  48.72 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.46 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  46.81 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50.42 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  47.66 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  46.84 
 
 		 437 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  47.26 
 
 		 238 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.72 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  47.48 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  47.66 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2144  ABC transporter related  47.88 
 
 		 238 aa  225  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  51.48 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 259 aa  224  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  47.48 
 
 		 242 aa  224  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.72 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  48.72 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.48 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  47.66 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  46.58 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  47.66 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  47.66 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  51.48 
 
 		 238 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  46.58 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.86 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  49.58 
 
 		 241 aa  221  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  49.79 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  46.84 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  46.86 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.23 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  44.68 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.52 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.09 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  49.57 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>