More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1931 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  443  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  72.1 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  63.95 
 
 		 236 aa  296  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  62.23 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.27 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  56.84 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  54.01 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  54.01 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  50.86 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  49.79 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1138  ABC transporter related  55.56 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  56.84 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.07 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  53.65 
 
 		 234 aa  245  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  49.79 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.16 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.64 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  54.89 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  51.5 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.74 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.14 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  55.36 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  55.36 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  50.64 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  53.59 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  51.71 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  52.79 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.71 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.29 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  51.5 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  55.74 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  47.64 
 
 		 231 aa  237  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.71 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  54.74 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.07 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 		 234 aa  234  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 259 aa  234  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  49.36 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.92 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  52.32 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  45.92 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  53.85 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  45.92 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.29 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  47.64 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.93 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  45.49 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  54.74 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.88 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  51.49 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  50.21 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.06 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  45.06 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.06 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.36 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  44.64 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.06 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.5 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.73 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.43 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  45.92 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.73 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.88 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.73 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  51.63 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.94 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  49.36 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>