More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1566 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
235 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  54.08 
 
 
234 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 
234 aa  256  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  53.22 
 
 
235 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 
241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.36 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  54.08 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  53.42 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51.93 
 
 
234 aa  251  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  251  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.14 
 
 
239 aa  250  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
234 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 
234 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  54.51 
 
 
235 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 
234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.65 
 
 
235 aa  248  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  52.79 
 
 
237 aa  248  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  54.31 
 
 
235 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  53.42 
 
 
234 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  50.64 
 
 
236 aa  247  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
237 aa  247  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.5 
 
 
238 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.5 
 
 
238 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  55.36 
 
 
258 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.28 
 
 
239 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  53.42 
 
 
231 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  53.22 
 
 
237 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  54.27 
 
 
236 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.36 
 
 
235 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
233 aa  244  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.28 
 
 
237 aa  244  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  53.22 
 
 
242 aa  244  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
235 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  49.36 
 
 
236 aa  244  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  50 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  53.85 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  48.93 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  48.5 
 
 
238 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  50.43 
 
 
237 aa  242  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  48.5 
 
 
238 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  54.51 
 
 
238 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  48.5 
 
 
238 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  48.5 
 
 
238 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  48.93 
 
 
238 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
238 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  52.99 
 
 
235 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.07 
 
 
238 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 
244 aa  241  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.29 
 
 
236 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 
234 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  50.86 
 
 
238 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  52.56 
 
 
235 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  50.21 
 
 
238 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  49.36 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  54.51 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.79 
 
 
236 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  52.36 
 
 
235 aa  238  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.64 
 
 
238 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.36 
 
 
236 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  51.71 
 
 
233 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 
236 aa  238  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  48.5 
 
 
238 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  48.07 
 
 
237 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50.64 
 
 
233 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  50.85 
 
 
239 aa  235  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  49.57 
 
 
235 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  48.07 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  49.79 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  51.07 
 
 
237 aa  234  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.27 
 
 
239 aa  234  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  51.5 
 
 
237 aa  234  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  49.79 
 
 
239 aa  234  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  51.5 
 
 
234 aa  234  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.25 
 
 
247 aa  234  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  50.83 
 
 
247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  49.79 
 
 
264 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  49.79 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.08 
 
 
242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  51.93 
 
 
233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  53.22 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  52.99 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  51.93 
 
 
238 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.36 
 
 
233 aa  232  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  48.5 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>