More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5991 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  72.1 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  63.52 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  60.09 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.36 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  53.22 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 234 aa  245  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  53.85 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  50.85 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.36 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.14 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  49.15 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  49.15 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  49.15 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  47.21 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1138  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50.64 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  47.21 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  46.15 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.64 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.07 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  48.73 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.93 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  50.63 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.52 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.92 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.07 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  46.12 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.21 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  48.72 
 
 		 236 aa  228  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  52.94 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  47.41 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.5 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  50.85 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  47.64 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  46.15 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  46.35 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  50.85 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  49.37 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  44.92 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  48.72 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  45.49 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  45.49 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  49.14 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.12 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  48.95 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  45.49 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45.06 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  224  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  44.64 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  47.21 
 
 		 237 aa  223  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 242 aa  223  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.21 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.21 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  47.21 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  47.64 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>