More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2182 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 
238 aa  463  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  98.32 
 
 
238 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  98.32 
 
 
238 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  60.5 
 
 
238 aa  285  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  57.92 
 
 
242 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.43 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  58.61 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  62.08 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  62.08 
 
 
240 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  269  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  58.33 
 
 
240 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  57.92 
 
 
238 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  54.62 
 
 
239 aa  263  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  263  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  262  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  56.07 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
247 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  57.63 
 
 
234 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.2 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  54.36 
 
 
247 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 
234 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 
247 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
247 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  54.85 
 
 
234 aa  247  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.62 
 
 
235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51.26 
 
 
234 aa  244  6.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.68 
 
 
239 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
237 aa  242  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.68 
 
 
244 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.16 
 
 
236 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  52.72 
 
 
247 aa  240  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.58 
 
 
236 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  53.36 
 
 
437 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  51.26 
 
 
249 aa  239  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.92 
 
 
235 aa  238  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  54.2 
 
 
270 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.42 
 
 
239 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  55.9 
 
 
263 aa  238  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
233 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50.42 
 
 
233 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.1 
 
 
233 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
237 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  52.32 
 
 
234 aa  237  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  53.36 
 
 
240 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.88 
 
 
247 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.2 
 
 
234 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  49.58 
 
 
260 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  52.52 
 
 
235 aa  235  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 
233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  53.16 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  52.1 
 
 
258 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  52.1 
 
 
248 aa  235  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  51.68 
 
 
233 aa  234  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  52.52 
 
 
233 aa  234  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  54.62 
 
 
236 aa  234  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  53.81 
 
 
234 aa  234  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  52.52 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  51.87 
 
 
242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  54.58 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.74 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  51.68 
 
 
255 aa  232  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  52.1 
 
 
234 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.32 
 
 
234 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  232  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.78 
 
 
234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  51.9 
 
 
251 aa  232  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  55.23 
 
 
234 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.74 
 
 
237 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  51.87 
 
 
247 aa  231  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  55.9 
 
 
266 aa  231  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  51.87 
 
 
246 aa  231  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50.84 
 
 
235 aa  231  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  50.42 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  54.01 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  48.35 
 
 
243 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.32 
 
 
237 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  52.1 
 
 
245 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.84 
 
 
236 aa  231  9e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  49.58 
 
 
233 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  49.58 
 
 
233 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.04 
 
 
236 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.74 
 
 
235 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  51.05 
 
 
251 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.58 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  52.52 
 
 
242 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  50.42 
 
 
234 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  50.42 
 
 
234 aa  230  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.32 
 
 
238 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 
249 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  54.15 
 
 
266 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  52.52 
 
 
233 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  51.05 
 
 
252 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  52.1 
 
 
246 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>