More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0609 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  89.58 
 
 		 240 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  81.51 
 
 		 242 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  79.92 
 
 		 244 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  79.51 
 
 		 244 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  78.15 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  75.42 
 
 		 240 aa  357  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  75 
 
 		 240 aa  353  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  75 
 
 		 240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  70 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  59.09 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  59.09 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 259 aa  261  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  54.01 
 
 		 238 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  52.74 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.94 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.74 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  51.9 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.74 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  53.59 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  53.59 
 
 		 260 aa  255  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  51.9 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  51.9 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  50.63 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.48 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.32 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.68 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  51.9 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.48 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.26 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.3 
 
 		 235 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  54.2 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  50.63 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.72 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  51.05 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  51.25 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 247 aa  248  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  51.05 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.26 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.1 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  51.05 
 
 		 235 aa  248  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.9 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  53.14 
 
 		 238 aa  247  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50.63 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  53.59 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.26 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.3 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.9 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.84 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.26 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.52 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  54.43 
 
 		 244 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  51.48 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  49.37 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  51.68 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  52.32 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  50.63 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.52 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51.9 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  242  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  53.36 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  242  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.48 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  51.68 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  50.62 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  51.68 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 234 aa  242  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  51.26 
 
 		 236 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.78 
 
 		 234 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  52.74 
 
 		 437 aa  241  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  54.01 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  52.52 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  54.01 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>