More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0364 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  100 
 
 		 437 aa  889    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  67.09 
 
 		 264 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  61.8 
 
 		 233 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  61.37 
 
 		 234 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  61.37 
 
 		 233 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  61.8 
 
 		 234 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  57.87 
 
 		 236 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  56.3 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  57.45 
 
 		 236 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  55.46 
 
 		 247 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  53.65 
 
 		 237 aa  266  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 247 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  55.46 
 
 		 247 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  53.88 
 
 		 233 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  55.46 
 
 		 247 aa  262  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  53.65 
 
 		 241 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  54.08 
 
 		 234 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  56.3 
 
 		 247 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.29 
 
 		 233 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  52.14 
 
 		 237 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 233 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  53.81 
 
 		 247 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 294 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  54.01 
 
 		 238 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 233 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  54.08 
 
 		 237 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 245 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 		 234 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  52.59 
 
 		 233 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  53.88 
 
 		 240 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.5 
 
 		 238 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 235 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  53.19 
 
 		 242 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.22 
 
 		 238 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  51.72 
 
 		 236 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  55.56 
 
 		 238 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  52.59 
 
 		 233 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 		 234 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 234 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.93 
 
 		 235 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  53.42 
 
 		 236 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  54.31 
 
 		 235 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  52.79 
 
 		 238 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.97 
 
 		 239 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 238 aa  250  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  52.52 
 
 		 242 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 235 aa  249  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50 
 
 		 239 aa  249  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.49 
 
 		 238 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  52.97 
 
 		 235 aa  249  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  52.54 
 
 		 264 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  50.63 
 
 		 251 aa  249  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  52.56 
 
 		 242 aa  249  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.84 
 
 		 233 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  49.14 
 
 		 233 aa  249  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  51.49 
 
 		 239 aa  249  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  53.78 
 
 		 241 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  54.85 
 
 		 246 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  53.45 
 
 		 240 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  54.51 
 
 		 236 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  52.14 
 
 		 242 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  51.02 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  52.54 
 
 		 265 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.28 
 
 		 243 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  52.12 
 
 		 239 aa  248  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  52.14 
 
 		 244 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  53.65 
 
 		 234 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  54.85 
 
 		 240 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  51.28 
 
 		 235 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  53.22 
 
 		 234 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  50.21 
 
 		 237 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  50.21 
 
 		 237 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 237 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 237 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 241 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  50.85 
 
 		 239 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>