More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0296 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  90 
 
 		 240 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  90 
 
 		 240 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  75 
 
 		 240 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  71.97 
 
 		 242 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  75.42 
 
 		 240 aa  357  8e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  72.13 
 
 		 244 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  72.69 
 
 		 238 aa  354  5e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  72.13 
 
 		 244 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  70.83 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  63.33 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  63.33 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  62.08 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  58.33 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  55.04 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  55.46 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  53.59 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.26 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  53.16 
 
 		 235 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.32 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  52.74 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  54.01 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  55.78 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  51.68 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  53.59 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  51.9 
 
 		 265 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.9 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  54.85 
 
 		 437 aa  248  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  52.52 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  51.9 
 
 		 264 aa  247  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  52.32 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  54.2 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  54.43 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.74 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.48 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.9 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  50.63 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.32 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  52.92 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  51.48 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  52.94 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  52.32 
 
 		 239 aa  244  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.63 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.59 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 247 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  51.48 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  53.59 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  53.16 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  53.59 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  51.48 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.59 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  47.7 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  54.01 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.21 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 234 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.37 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  51.05 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.74 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.58 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  49.58 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  53.16 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  51.68 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50.21 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.94 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.68 
 
 		 236 aa  238  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  51.05 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  51.48 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  50.63 
 
 		 242 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  50.63 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  50.63 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  51.91 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  52.7 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.52 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  55.04 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>