More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4056 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  72.08 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  72.08 
 
 
240 aa  351  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  70.89 
 
 
238 aa  351  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  70 
 
 
240 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  69.04 
 
 
242 aa  346  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  70.83 
 
 
240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  68.85 
 
 
244 aa  340  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  70 
 
 
240 aa  339  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  68.03 
 
 
244 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  61.98 
 
 
238 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  61.98 
 
 
238 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  61.67 
 
 
238 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  55.7 
 
 
234 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  54.85 
 
 
234 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  54.43 
 
 
235 aa  257  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  54.85 
 
 
234 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.74 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  54.62 
 
 
258 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  53.14 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  53.16 
 
 
259 aa  249  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  52.74 
 
 
238 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.32 
 
 
234 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  52.3 
 
 
238 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
237 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  53.59 
 
 
256 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  52.3 
 
 
236 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  49.16 
 
 
236 aa  246  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.32 
 
 
244 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
235 aa  245  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  52.12 
 
 
234 aa  244  6e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.52 
 
 
235 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  53.16 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  52.1 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.9 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51.9 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  53.36 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.74 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  52.94 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  55.23 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  52.32 
 
 
240 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  49.16 
 
 
238 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.74 
 
 
238 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  49.16 
 
 
238 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.74 
 
 
238 aa  241  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.63 
 
 
239 aa  241  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  49.37 
 
 
239 aa  241  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  49.58 
 
 
238 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  49.58 
 
 
238 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.32 
 
 
238 aa  241  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.21 
 
 
239 aa  241  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.52 
 
 
247 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  51.88 
 
 
247 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  48.32 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  48.32 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  51.88 
 
 
247 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.63 
 
 
234 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
234 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  47.9 
 
 
238 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  51.88 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  53.59 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  54.04 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 
238 aa  238  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  52.1 
 
 
242 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  48.32 
 
 
238 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.26 
 
 
236 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  54.85 
 
 
237 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  52.94 
 
 
247 aa  238  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  51.88 
 
 
253 aa  238  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  50 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  51.88 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  51.88 
 
 
237 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
234 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50 
 
 
242 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.37 
 
 
233 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.58 
 
 
237 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
238 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  53.25 
 
 
234 aa  237  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  53.78 
 
 
237 aa  237  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.59 
 
 
235 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  49.58 
 
 
238 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  51.68 
 
 
233 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  51.68 
 
 
239 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.74 
 
 
244 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  53.59 
 
 
237 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  50.42 
 
 
251 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  52.52 
 
 
238 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.26 
 
 
236 aa  235  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.32 
 
 
236 aa  235  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>