More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3709 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 244 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  97.95 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  79.42 
 
 		 242 aa  410  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  79.92 
 
 		 240 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  79.51 
 
 		 240 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  75.1 
 
 		 238 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  72.13 
 
 		 240 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  68.85 
 
 		 240 aa  340  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  68.85 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  68.85 
 
 		 240 aa  337  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  60.16 
 
 		 238 aa  278  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  60.16 
 
 		 238 aa  278  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  59.43 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  56.85 
 
 		 237 aa  255  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  53.11 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.7 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.45 
 
 		 236 aa  251  9.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.7 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  51.24 
 
 		 249 aa  248  9e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.87 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  53.11 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  52.07 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.45 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.28 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.07 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.87 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.83 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.21 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  49.79 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 247 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  52.05 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.38 
 
 		 239 aa  242  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  52.28 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  51.65 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  53.72 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  54.13 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.38 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  53.94 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.38 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50.41 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.97 
 
 		 237 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.53 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.96 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  49.38 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  47.93 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.62 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  53.11 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  49.38 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  51.45 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  49.39 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.45 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.72 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  50.62 
 
 		 822 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  49.59 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  52.4 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  53.25 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.56 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.45 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  49.59 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  51.04 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  51.87 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  53.88 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50.62 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  52.48 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  51.45 
 
 		 437 aa  235  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  52.87 
 
 		 299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  48.76 
 
 		 238 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  50.83 
 
 		 237 aa  234  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  50.83 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 		 244 aa  234  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.85 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>