More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0335 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  83.94 
 
 		 238 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  63.01 
 
 		 238 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  56.91 
 
 		 239 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  52.23 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.72 
 
 		 235 aa  251  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  55.78 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.44 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  55.78 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  55.78 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  51.2 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  53.66 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  52.03 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.84 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  54.03 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  52.8 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 235 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  51.42 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  53.88 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.84 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  53.25 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.4 
 
 		 244 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  54.47 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  53.25 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 		 234 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  52.82 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  52.21 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  53.06 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  47.2 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  52.24 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  52.8 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50.2 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 235 aa  234  9e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  49.4 
 
 		 239 aa  234  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.2 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  50.6 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.63 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50.61 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  52.02 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  50.81 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.59 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  52.61 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  52.4 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.2 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  51.79 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  52.99 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  53.01 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.39 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  51.82 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  54.47 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.99 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  51.63 
 
 		 242 aa  231  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.19 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  49.4 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 242 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  50.4 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.61 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  51.63 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.97 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  49.39 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  49.39 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  52.21 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  51.6 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  49.39 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  45.56 
 
 		 238 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  52.23 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.37 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.42 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50.81 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.37 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.2 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.16 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  52.23 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  50.2 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  50.2 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  51.01 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  50.41 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  45.16 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  49.4 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  45.16 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>