More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2310 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  60.85 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  60.52 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  57.94 
 
 		 235 aa  284  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  61.97 
 
 		 235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  59.66 
 
 		 235 aa  279  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 234 aa  277  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  58.97 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  57.02 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  60.26 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  57.45 
 
 		 260 aa  274  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  58.37 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  59.57 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  58.8 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  57.87 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 234 aa  271  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  57.69 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  60.09 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  57.02 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  58.05 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  59.66 
 
 		 239 aa  269  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  58.72 
 
 		 235 aa  269  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  57.26 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  56.41 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  57.94 
 
 		 235 aa  267  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  57.87 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  57.08 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  56.54 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  54.47 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  57.63 
 
 		 238 aa  265  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  55.79 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.04 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  56.6 
 
 		 235 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  57.14 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.71 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  56.22 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  55.36 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  55.51 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  53.85 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.7 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  57.51 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  57.94 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  55.08 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  52.36 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.79 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 234 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.36 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  51.71 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  55.08 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  51.71 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.36 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  52.99 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  53.22 
 
 		 244 aa  254  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  54.81 
 
 		 245 aa  254  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  53.62 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  55.46 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.99 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  53.42 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  56.22 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  52.54 
 
 		 237 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  56.65 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  52.77 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  55.36 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  52.77 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  52.77 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  54.85 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>