More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0477 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  77.31 
 
 		 239 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  60.5 
 
 		 238 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  60.08 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  60.08 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  52.1 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  50.42 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.2 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.07 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  50.84 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  51.24 
 
 		 244 aa  244  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.1 
 
 		 239 aa  244  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  52.94 
 
 		 240 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  52.52 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  52.1 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.32 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  51.68 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.1 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.26 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  51.05 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  50.84 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  51.68 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  49.37 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  52.5 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  45.8 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  50.84 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  50.84 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  49.58 
 
 		 237 aa  235  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  47.9 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.32 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  50.6 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  49.16 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.9 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.84 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  47.9 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  51.26 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.16 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  49.58 
 
 		 437 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50.84 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  51.68 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  51.68 
 
 		 235 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  52.1 
 
 		 235 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  51.26 
 
 		 234 aa  231  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  51.68 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  49.16 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  47.92 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  51.68 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  50.21 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  46.64 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  47.48 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  228  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  49.16 
 
 		 237 aa  228  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.06 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  48.77 
 
 		 240 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  48.74 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  50.84 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.84 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  48.74 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  48.32 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.22 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  48.32 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  50.21 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  50.84 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.42 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.9 
 
 		 235 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  47.9 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  45.38 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.74 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  46.22 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  47.06 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  47.48 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.74 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  46.69 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  46.69 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  46.67 
 
 		 233 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.26 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.48 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  47.28 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  46.25 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.16 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  46.25 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  46.25 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>