More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1677 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.79 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  61.79 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  60.57 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  58.94 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  62.2 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  58.54 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  57.38 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  60.33 
 
 		 246 aa  276  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.2 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  57.63 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  53.81 
 
 		 437 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.51 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  52.85 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  57.63 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  54.51 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 234 aa  251  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  56.78 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  54.24 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  53.78 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  52.32 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 		 235 aa  249  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  54.01 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  55.08 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  53.16 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.1 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50.85 
 
 		 233 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  54.62 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  55.79 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  53.39 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  53.36 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  52.97 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  52.54 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  54.43 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50.63 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  52.32 
 
 		 237 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  52.32 
 
 		 236 aa  245  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  49.58 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.16 
 
 		 239 aa  244  8e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  53.39 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.97 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  52.97 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.12 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  53.81 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  53.81 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  51.9 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  55.08 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  48.73 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  53.59 
 
 		 242 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  54.24 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.12 
 
 		 260 aa  239  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  49.58 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  52.12 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  58.05 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.05 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.27 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  52.32 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  48.31 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  52.1 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  48.31 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  52.1 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  54.62 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.31 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  52.12 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  48.31 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  48.31 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 233 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  52.12 
 
 		 233 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 235 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.21 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>