More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3016 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  99.19 
 
 		 247 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  89.07 
 
 		 247 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  88.02 
 
 		 253 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  72.57 
 
 		 239 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  70.76 
 
 		 239 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  69.49 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  66.39 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  66.39 
 
 		 236 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  65.68 
 
 		 256 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  65.82 
 
 		 237 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  65.68 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  65.13 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  62.39 
 
 		 251 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  58.9 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  57.81 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  58.3 
 
 		 237 aa  274  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  59.75 
 
 		 235 aa  274  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  57.38 
 
 		 264 aa  274  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  55.32 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  55.93 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  58.47 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.17 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  54.04 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  57.02 
 
 		 236 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  56.12 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  58.05 
 
 		 237 aa  268  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  58.72 
 
 		 258 aa  267  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  58.05 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  54.89 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  55.7 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  55.74 
 
 		 238 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 235 aa  265  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  54.89 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  58.47 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.32 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  54.62 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  57.63 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  55.74 
 
 		 234 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.6 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  56.12 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  53.78 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  55.93 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  53.75 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  53.33 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.93 
 
 		 235 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.32 
 
 		 238 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  54.04 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.6 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  53.39 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.43 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.34 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  50.42 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.68 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  56.78 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.26 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  53.19 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.26 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.21 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  54.2 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  54.89 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  52.5 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  52.12 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  54.47 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  56.12 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  51.48 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  54.04 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  55.74 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  54.04 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.69 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>