More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0402 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  83.47 
 
 		 236 aa  408  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  66.09 
 
 		 233 aa  314  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  63.87 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  63.83 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  65.24 
 
 		 233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  65.24 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 		 234 aa  302  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  64.53 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  62.39 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  61.97 
 
 		 234 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  64.1 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  63.25 
 
 		 233 aa  298  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  61.54 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  60.68 
 
 		 239 aa  289  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  58.8 
 
 		 235 aa  288  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 237 aa  286  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  58.37 
 
 		 234 aa  285  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  58.8 
 
 		 238 aa  284  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  59.57 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  58.12 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  57.51 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 259 aa  281  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  59.23 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  58.55 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  58.12 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  57.08 
 
 		 235 aa  277  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  56.84 
 
 		 233 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  56.84 
 
 		 233 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  58.97 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  58.72 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  56.22 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  56.84 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  55.79 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  56.84 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.69 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  56.6 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  58.05 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  56.41 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  56.41 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.41 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  56.84 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  57.26 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  56.22 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  57.94 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  56.22 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  58.55 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  58.97 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  57.63 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.84 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  57.63 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  55.79 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  56.78 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  57.02 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  55.79 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  57.02 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  58.97 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  59.66 
 
 		 238 aa  271  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  55.56 
 
 		 238 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  58.55 
 
 		 256 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  57.94 
 
 		 237 aa  271  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  56.6 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  57.14 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  56.72 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.69 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.7 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.02 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  54.7 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  55.36 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  56.17 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  55.93 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  55.51 
 
 		 236 aa  268  8e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  53.22 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 247 aa  266  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  56.41 
 
 		 233 aa  266  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  54.7 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  54.94 
 
 		 241 aa  266  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  56.41 
 
 		 243 aa  266  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 242 aa  266  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  57.26 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  56.65 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  57.26 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.98 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  55.32 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>