More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3835 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  53.22 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  51.05 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  48.51 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.79 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.86 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  52.72 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 234 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  48.29 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  47.44 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  48.29 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.79 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  47.01 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50.64 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.93 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  47.44 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  47.01 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.5 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  52.32 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  47.46 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50.85 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  51.07 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.15 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 		 244 aa  241  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  53.42 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.79 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.49 
 
 		 239 aa  241  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  53.75 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  52.99 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  51.93 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  47.9 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.5 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  47.9 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1162  ABC transporter related  49.79 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.596535 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.36 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  50.85 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  51.68 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  48.31 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.07 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  51.28 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  51.5 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  51.49 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.85 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  50.63 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  52.52 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50.63 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  47.26 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.07 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  51.28 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  54.04 
 
 		 246 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  234  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  52.79 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.34 
 
 		 241 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  50.85 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  49.15 
 
 		 239 aa  234  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  51.91 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  53.62 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  50.85 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.85 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  53.19 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  53.62 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  51.28 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>