More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0223 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.98 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  58.37 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  55.93 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.7 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 235 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.56 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  54.04 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.79 
 
 		 235 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.99 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  55.98 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  54.47 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  55.98 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  54.47 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  54.47 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  56.22 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  53.78 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50.64 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  52.54 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.13 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  54.27 
 
 		 236 aa  247  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  52.36 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  49.58 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  51.5 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.7 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.46 
 
 		 256 aa  244  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.65 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  48.73 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  48.73 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  48.73 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.31 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  48.31 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.27 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  48.31 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  50.21 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 235 aa  242  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  49.79 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  50.81 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.99 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.88 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  51.91 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  51.5 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50.21 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.46 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  53.42 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  52.77 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50.85 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  53.42 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.42 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  51.07 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  52.56 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  50.85 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 233 aa  234  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  50.64 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>