More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1215 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  63.83 
 
 		 236 aa  295  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  60.94 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  57.02 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  61.54 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  54.94 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 234 aa  267  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 238 aa  267  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  265  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.85 
 
 		 234 aa  265  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  53.22 
 
 		 238 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 235 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.36 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.22 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  54.51 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  59.57 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  51.93 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  56.17 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  57.69 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  53.65 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  53.65 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  54.47 
 
 		 237 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  54.51 
 
 		 235 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  55.51 
 
 		 237 aa  261  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  54.51 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  52.34 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  51.5 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 249 aa  258  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  51.49 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.22 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.93 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  55.7 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  52.77 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  54.08 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.51 
 
 		 239 aa  254  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.64 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  54.51 
 
 		 239 aa  254  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 		 236 aa  254  9e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  53.22 
 
 		 242 aa  254  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  51.07 
 
 		 237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  56.3 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  53.65 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.65 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  50.21 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  52.12 
 
 		 237 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.5 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.34 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  55.04 
 
 		 247 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  54.94 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.32 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  53.22 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  52.79 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.93 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  54.27 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  54.51 
 
 		 437 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  53.62 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.56 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  53.65 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  53.65 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.27 
 
 		 241 aa  247  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.28 
 
 		 235 aa  247  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  52.79 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  52.36 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  52.36 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  56.22 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  52.77 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  52.14 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  53.62 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>