More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0098 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  76.03 
 
 		 254 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  75.31 
 
 		 254 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  75.62 
 
 		 254 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  75.31 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  74.9 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  56.41 
 
 		 235 aa  281  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  54.51 
 
 		 235 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  60.94 
 
 		 245 aa  268  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  51.07 
 
 		 259 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.88 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  53.85 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  51.48 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.99 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  51.5 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.84 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  53.62 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  54.01 
 
 		 237 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.08 
 
 		 242 aa  251  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  54.27 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.95 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  52.74 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.14 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.29 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  56.07 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  48.1 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  48.1 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  52.56 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  52.56 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.94 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  52.99 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  53.85 
 
 		 233 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.56 
 
 		 233 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.07 
 
 		 235 aa  245  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  52.79 
 
 		 234 aa  244  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.94 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  52.14 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.22 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.21 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  48.94 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  50.63 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  52.36 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.91 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  51.9 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  51.9 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  49.57 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.95 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  51.71 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  54.24 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 235 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  51.5 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  51.5 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  48.51 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  52.3 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.93 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  51.5 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>