More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0464 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  68.78 
 
 
237 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  62.39 
 
 
233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
247 aa  284  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  59.32 
 
 
239 aa  284  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  60.26 
 
 
235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  55.04 
 
 
247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  58.05 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  58.12 
 
 
239 aa  278  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  60.43 
 
 
234 aa  278  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
233 aa  277  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  56.22 
 
 
249 aa  276  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  58.12 
 
 
239 aa  276  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  58.72 
 
 
235 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 
234 aa  275  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.87 
 
 
235 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  57.51 
 
 
233 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  56.17 
 
 
234 aa  274  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  56.84 
 
 
234 aa  274  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  56.84 
 
 
234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  57.94 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  55.13 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  59.32 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  54.89 
 
 
235 aa  271  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.84 
 
 
234 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  54.51 
 
 
237 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  55.13 
 
 
256 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.56 
 
 
236 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  55.98 
 
 
259 aa  268  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  55.56 
 
 
236 aa  268  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  54.7 
 
 
245 aa  268  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  53.78 
 
 
247 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.1 
 
 
239 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  51.28 
 
 
238 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.97 
 
 
237 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.68 
 
 
247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  53.81 
 
 
251 aa  265  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  55.93 
 
 
260 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  51.93 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  51.28 
 
 
238 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  53.85 
 
 
236 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  53.85 
 
 
242 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  52.94 
 
 
247 aa  264  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.04 
 
 
238 aa  264  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  53.85 
 
 
242 aa  264  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 
238 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.01 
 
 
236 aa  263  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.42 
 
 
235 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 
242 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  52.14 
 
 
248 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 
247 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  54.94 
 
 
258 aa  262  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  54.7 
 
 
237 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  56.36 
 
 
237 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 
244 aa  262  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
234 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  52.79 
 
 
236 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  55.56 
 
 
235 aa  262  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.28 
 
 
238 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.28 
 
 
238 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  54.85 
 
 
236 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50.43 
 
 
238 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50.43 
 
 
238 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50.43 
 
 
238 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 
238 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.43 
 
 
238 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  51.71 
 
 
234 aa  261  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50 
 
 
238 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  55.7 
 
 
237 aa  260  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50 
 
 
238 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  54.24 
 
 
237 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 
238 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.36 
 
 
233 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  53.62 
 
 
244 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  51.28 
 
 
238 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  51.26 
 
 
247 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  55.08 
 
 
237 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  52.99 
 
 
238 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.27 
 
 
234 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 
235 aa  257  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  51.93 
 
 
242 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 
238 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
235 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  54.7 
 
 
244 aa  256  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  54.04 
 
 
234 aa  256  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 
238 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  52.99 
 
 
234 aa  255  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  51.28 
 
 
234 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  53.19 
 
 
234 aa  255  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  51.71 
 
 
264 aa  255  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  51.68 
 
 
239 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>