More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0988 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 247 aa  490  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  74.59 
 
 		 252 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  73.11 
 
 		 249 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  67.21 
 
 		 247 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  65.98 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  65.98 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  65.16 
 
 		 247 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.6 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.45 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  63.2 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  66.39 
 
 		 270 aa  315  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  63.45 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  63.45 
 
 		 252 aa  314  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  64.75 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  62.4 
 
 		 253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  62.65 
 
 		 251 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  62.65 
 
 		 251 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  62.65 
 
 		 251 aa  310  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  62.65 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  63.03 
 
 		 255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.86 
 
 		 251 aa  304  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.86 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  62.34 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  61.51 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  61.6 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.04 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  61.11 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  60.68 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  57.72 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  57.08 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 		 249 aa  285  7e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  61.67 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  61.54 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.26 
 
 		 271 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  57.61 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  59.17 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  61.04 
 
 		 231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  56.9 
 
 		 239 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  57.26 
 
 		 239 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  57.32 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  53.72 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  54.39 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  57.79 
 
 		 243 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  52.48 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.89 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.07 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  53.78 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 		 238 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  52.48 
 
 		 247 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  51.9 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.77 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  51.65 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.91 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  51.91 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  51.91 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.34 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  53.39 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.34 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  50.41 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.94 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.41 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  49.58 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.51 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  48.31 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  48.54 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  49.79 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1115  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  52.3 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  52.72 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.23 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.66 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  47.46 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  50.42 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  49.79 
 
 		 240 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>