More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0266 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  77.46 
 
 		 252 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  73.11 
 
 		 247 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  64.05 
 
 		 247 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  64.05 
 
 		 247 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  63.79 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.96 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  62.96 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.96 
 
 		 251 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  62.96 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.61 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  62.96 
 
 		 252 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.2 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  63.22 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.2 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.2 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.2 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.2 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  62.55 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  62.55 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  62.55 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  61.98 
 
 		 247 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.79 
 
 		 251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  62.92 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  60.74 
 
 		 247 aa  296  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  60.16 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  62.03 
 
 		 270 aa  294  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  59.41 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  60.42 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  59.41 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  57.14 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.66 
 
 		 271 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  56.25 
 
 		 248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  57.14 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  54.32 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  58.54 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  59.82 
 
 		 231 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  55.56 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  57.2 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  54.7 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  54.27 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  53.09 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  53.11 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  52.77 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  52.67 
 
 		 247 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  53.09 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.44 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  53.36 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  51.05 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  51.87 
 
 		 243 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.9 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.52 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  51.46 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50.42 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  50.21 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  51.85 
 
 		 247 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  50.41 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  54.2 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  51.67 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  47.88 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.41 
 
 		 244 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  52.92 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.74 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  51.49 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  47.28 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  52.92 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  46.86 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  51.49 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  46.86 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  46.86 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  46.86 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  53.16 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.97 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.34 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  46.44 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  51.25 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  49.37 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  52.54 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  47.72 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>