More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3361 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  496  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  92.71 
 
 
247 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  87.85 
 
 
247 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  85.02 
 
 
247 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  85.02 
 
 
247 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  81.15 
 
 
252 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  80.08 
 
 
250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  80.33 
 
 
251 aa  400  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  80.33 
 
 
254 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  80.74 
 
 
252 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  80.33 
 
 
251 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  80.33 
 
 
251 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  79.92 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  79.1 
 
 
251 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.72 
 
 
252 aa  380  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  75.82 
 
 
253 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.13 
 
 
251 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.13 
 
 
251 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.13 
 
 
251 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.13 
 
 
251 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.54 
 
 
251 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.54 
 
 
251 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.13 
 
 
252 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  65.13 
 
 
248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  65.16 
 
 
247 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  68.31 
 
 
270 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  64.78 
 
 
251 aa  316  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  66.53 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  63.64 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  61.98 
 
 
249 aa  305  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  61.22 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  60.58 
 
 
252 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  64.05 
 
 
255 aa  298  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  59.41 
 
 
241 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  59.41 
 
 
241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  59.75 
 
 
243 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 
241 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  62.39 
 
 
231 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  58.13 
 
 
239 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
249 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  56.1 
 
 
255 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  58.44 
 
 
243 aa  278  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  59 
 
 
249 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  57.68 
 
 
252 aa  274  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.98 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  60.67 
 
 
251 aa  272  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  57.2 
 
 
248 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  56.1 
 
 
239 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  56.5 
 
 
239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  58.26 
 
 
243 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  52.28 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
247 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  51.43 
 
 
247 aa  244  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50.84 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  52.07 
 
 
236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  51.64 
 
 
240 aa  241  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  51.43 
 
 
247 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  50.61 
 
 
247 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50.83 
 
 
238 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.07 
 
 
236 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.26 
 
 
235 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
235 aa  238  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50.63 
 
 
245 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  51.43 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.08 
 
 
239 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
256 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.17 
 
 
239 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.2 
 
 
247 aa  234  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  48.56 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  50.84 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.38 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50.2 
 
 
247 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
234 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  51.68 
 
 
237 aa  231  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  46.89 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  50.42 
 
 
243 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  46.89 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.54 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  46.89 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
233 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  48.95 
 
 
234 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  47.06 
 
 
233 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  48.12 
 
 
236 aa  230  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.37 
 
 
238 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  46.86 
 
 
233 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  49.58 
 
 
233 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.25 
 
 
235 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
244 aa  228  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  47.28 
 
 
238 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  47.28 
 
 
238 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
231 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
243 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 
238 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.74 
 
 
236 aa  228  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  47.06 
 
 
238 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
234 aa  228  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  46.86 
 
 
237 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  50.41 
 
 
237 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.64 
 
 
236 aa  227  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.33 
 
 
235 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>