More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5330 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  477  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  61.9 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.33 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.84 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  59.49 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  59.92 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 247 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  60.42 
 
 		 247 aa  284  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  60.32 
 
 		 251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  60.42 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  60.32 
 
 		 251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  60.8 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  61.04 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  60.83 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  59.92 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.58 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  61.51 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  58.94 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  58.33 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  59.92 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  58.26 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  61.18 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  61.04 
 
 		 239 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  57.79 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  59.83 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  59.83 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  59.75 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  59.32 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  59.66 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  55.42 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  61.51 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  56.84 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  59.02 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  57.5 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  59.91 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  59.32 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  58.47 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  58.8 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  60.83 
 
 		 243 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.19 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  54.39 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  53.19 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  53.78 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  54.27 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.42 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  52.79 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.94 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.93 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  52.7 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50.84 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  52.14 
 
 		 243 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  55.27 
 
 		 240 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  50.89 
 
 		 234 aa  225  6e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 235 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  54.63 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.69 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  50.21 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  47.26 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.68 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  47.62 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  47.26 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  52.56 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  51.72 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.31 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  54.63 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  54.63 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  49.16 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  46.41 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.95 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>