More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3247 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  67.39 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  65.07 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  62.39 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  64.07 
 
 		 251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  63.64 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  65.22 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  61.47 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  61.86 
 
 		 247 aa  280  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  61.47 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  63.88 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  61.44 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  61.74 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  64.63 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  60.94 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  64.63 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.09 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  60.59 
 
 		 247 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  60.59 
 
 		 247 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  61.04 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  58.78 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  59.91 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  59.48 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  58.37 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  58.37 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.13 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  58.13 
 
 		 251 aa  267  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  57.64 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  57.63 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 249 aa  265  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.55 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.55 
 
 		 251 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  59.82 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  57.64 
 
 		 239 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  57.64 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.55 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.12 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  57.21 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.46 
 
 		 271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  55.6 
 
 		 248 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  56.96 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  57.64 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  62.28 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  59.91 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  57.14 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 		 249 aa  247  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  50.88 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  53.48 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  53.04 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  50.66 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.28 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.07 
 
 		 234 aa  237  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.33 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.53 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  53.04 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50.66 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.26 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.04 
 
 		 235 aa  234  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  52.19 
 
 		 234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.87 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.06 
 
 		 247 aa  231  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  48.71 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  52.17 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.67 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.67 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  51.91 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  49.12 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  48.02 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  52.4 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 256 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  48.7 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  48.7 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  51.97 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  53.04 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.91 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  50.43 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.91 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  53.98 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.74 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  48.7 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  48.7 
 
 		 241 aa  224  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  48.89 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>