More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1325 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  100 
 
 
243 aa  477  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  85.95 
 
 
249 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  58.33 
 
 
270 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  58.51 
 
 
248 aa  281  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  58.44 
 
 
247 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  56.73 
 
 
252 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  58.16 
 
 
251 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  55.19 
 
 
253 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.38 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  56.15 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  57.02 
 
 
247 aa  272  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  55.92 
 
 
251 aa  272  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  55.51 
 
 
251 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  55.51 
 
 
251 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  55.51 
 
 
251 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  57.02 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  57.02 
 
 
247 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  57.02 
 
 
247 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  56.79 
 
 
250 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 
251 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 
251 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.61 
 
 
254 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  55.79 
 
 
248 aa  268  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
251 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
251 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
251 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
252 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 
251 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  57.64 
 
 
231 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 
247 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  57.2 
 
 
236 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  54.58 
 
 
255 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  53.11 
 
 
248 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  57.2 
 
 
236 aa  261  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  54.73 
 
 
253 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
252 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  55.7 
 
 
236 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  53.81 
 
 
237 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  54.27 
 
 
252 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
241 aa  254  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  56.54 
 
 
237 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  51.91 
 
 
234 aa  254  8e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  56.12 
 
 
236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  53.36 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  53.62 
 
 
242 aa  252  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  53.62 
 
 
242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  54.66 
 
 
237 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  53.11 
 
 
249 aa  251  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
247 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  55.74 
 
 
244 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  53.19 
 
 
241 aa  250  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  53.19 
 
 
242 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  52.54 
 
 
238 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.74 
 
 
260 aa  249  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.24 
 
 
247 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.32 
 
 
235 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  53.81 
 
 
241 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  54.24 
 
 
239 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.14 
 
 
271 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.32 
 
 
236 aa  248  6e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  54.66 
 
 
239 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.69 
 
 
239 aa  247  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  52.97 
 
 
264 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  52.72 
 
 
252 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.69 
 
 
239 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  53.06 
 
 
247 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  51.91 
 
 
236 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  52.54 
 
 
265 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.04 
 
 
235 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  53.19 
 
 
241 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  53.47 
 
 
247 aa  245  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  52.63 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.91 
 
 
235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  53.62 
 
 
248 aa  244  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  53.06 
 
 
247 aa  244  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  51.68 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  53.85 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  56.41 
 
 
249 aa  244  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  50 
 
 
236 aa  244  9e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.69 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  51.27 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.06 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.23 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  49.58 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  54.43 
 
 
239 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  53.16 
 
 
237 aa  241  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
237 aa  241  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.91 
 
 
234 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  50.21 
 
 
234 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.06 
 
 
238 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
236 aa  239  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  53.81 
 
 
242 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
259 aa  239  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  54.04 
 
 
235 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.06 
 
 
238 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  50.41 
 
 
253 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.49 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>