More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1197 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  98.76 
 
 
242 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  63.75 
 
 
243 aa  304  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.96 
 
 
244 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  47.52 
 
 
242 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.15 
 
 
234 aa  238  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  51.28 
 
 
236 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.72 
 
 
233 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  48.12 
 
 
260 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  46.69 
 
 
242 aa  235  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  50.85 
 
 
236 aa  235  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  46.28 
 
 
242 aa  234  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
236 aa  234  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.42 
 
 
236 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  49.16 
 
 
247 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  48.73 
 
 
249 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
237 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  47.01 
 
 
231 aa  230  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  48.72 
 
 
236 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  48.29 
 
 
264 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.15 
 
 
238 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  47.44 
 
 
231 aa  228  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
238 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  47.86 
 
 
265 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.15 
 
 
234 aa  228  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
234 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  46.84 
 
 
238 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  49.15 
 
 
234 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  47.9 
 
 
239 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  47.66 
 
 
235 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  48.95 
 
 
243 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2144  ABC transporter related  49.36 
 
 
238 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
247 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 
234 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
238 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  46.69 
 
 
242 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 
234 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
247 aa  225  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  48.1 
 
 
237 aa  225  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  48.32 
 
 
239 aa  225  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  48.51 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.87 
 
 
238 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  45.99 
 
 
248 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  47.48 
 
 
239 aa  224  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  47.26 
 
 
243 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.32 
 
 
247 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  46.22 
 
 
247 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 
238 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
247 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.3 
 
 
238 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
236 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 
238 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
235 aa  222  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.99 
 
 
238 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  44.68 
 
 
238 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
237 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  44.68 
 
 
238 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.09 
 
 
235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  46.28 
 
 
241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.64 
 
 
234 aa  221  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
234 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  45.92 
 
 
234 aa  221  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  48.29 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  48.07 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  47.26 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
244 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  44.02 
 
 
238 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  47.56 
 
 
269 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  47.01 
 
 
234 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 
241 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  44.02 
 
 
238 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  44.44 
 
 
237 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.87 
 
 
236 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  51.28 
 
 
234 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.72 
 
 
242 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  45.04 
 
 
264 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  44.44 
 
 
237 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 
274 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  43.78 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  45.45 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  47.86 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.96 
 
 
236 aa  215  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  49.36 
 
 
237 aa  215  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  47.13 
 
 
247 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>