More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2144 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2144  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  57.56 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  47.23 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  47.23 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  46.81 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  46.81 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.81 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  46.81 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.81 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  47.23 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  48.09 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.66 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  46.58 
 
 		 238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  46.38 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.31 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  47.88 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  48.09 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  46.58 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  45.96 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  46.58 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.38 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  45.53 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  45.53 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  45.53 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.49 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  44.68 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  45.57 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  47.23 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  46.15 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.15 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  48.29 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  47.44 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 294 aa  214  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.96 
 
 		 239 aa  214  9e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.19 
 
 		 239 aa  213  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  47.86 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  44.02 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.16 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.44 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  47.21 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  43.4 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  44.96 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  44.12 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.12 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  48.07 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  48.29 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  43.59 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  45.96 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  44.02 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  47.66 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  46.78 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  49.57 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.01 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  47.46 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  39.74 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  46.61 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  46.58 
 
 		 247 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  43.46 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  45.76 
 
 		 243 aa  207  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  47.66 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  45.11 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  45.73 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>