More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1002 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  72.2 
 
 		 241 aa  338  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  62.82 
 
 		 234 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1743  ABC transporter related  60.34 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244455  normal  0.0815205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4241  ABC transporter related  59.49 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3556  ABC transporter related  59.49 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7077  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  59.07 
 
 		 236 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 236 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.7 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.77 
 
 		 259 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.43 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  52.77 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  52.77 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.77 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.91 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.77 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  55.56 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  52.77 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  55.56 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  51.27 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  52.14 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  52.56 
 
 		 235 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.75 
 
 		 239 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.71 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.14 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  54.02 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.14 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.43 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.41 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  49.15 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.56 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  46.41 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.01 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  52.08 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.57 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.14 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  48.09 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.15 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  46.41 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  46.41 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  51.05 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  54.02 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  52.5 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  51.5 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.57 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  53.59 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  48.54 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  48.09 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  50.64 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  49.36 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  48.95 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  47.5 
 
 		 263 aa  231  6e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  52.12 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  52.12 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  52.52 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  50.85 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.08 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.44 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.72 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  48.32 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>