More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0941 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 263 aa  534  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  97.34 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  97.34 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  64.64 
 
 		 263 aa  344  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  63.88 
 
 		 263 aa  341  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  61.36 
 
 		 276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  62.36 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  59.47 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  60.84 
 
 		 266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  58.71 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  58.94 
 
 		 291 aa  318  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  57.84 
 
 		 271 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  58.56 
 
 		 279 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  57.58 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.7 
 
 		 260 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  57.79 
 
 		 279 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  55.51 
 
 		 272 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  58.17 
 
 		 299 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  58.94 
 
 		 272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.2 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  57.2 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  57.79 
 
 		 279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  57.58 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  59.32 
 
 		 273 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  58.94 
 
 		 273 aa  311  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  57.95 
 
 		 271 aa  309  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  58.17 
 
 		 272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  57.79 
 
 		 279 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  57.03 
 
 		 280 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  57.03 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  57.03 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  58.94 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  55.89 
 
 		 281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  55.51 
 
 		 270 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  59.7 
 
 		 276 aa  305  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  56.65 
 
 		 269 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  56.65 
 
 		 269 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  53.99 
 
 		 276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  55.89 
 
 		 269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  55.89 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  57.95 
 
 		 281 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  57.03 
 
 		 265 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  55.51 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  53.61 
 
 		 272 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  55.51 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  57.36 
 
 		 270 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  56.06 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  55.89 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  54.92 
 
 		 277 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  54.75 
 
 		 278 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  53.99 
 
 		 279 aa  291  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  53.99 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  53.94 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  51.2 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 235 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.17 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.72 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.21 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  51.45 
 
 		 258 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.41 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  49.79 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.83 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.83 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.71 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  47.33 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  53.75 
 
 		 234 aa  235  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  48.33 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  46.18 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  47.5 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  47.58 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  50.83 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  52.08 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  48.37 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.59 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.17 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  47.58 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.97 
 
 		 244 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  50.83 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.38 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.58 
 
 		 236 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  45.68 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  47.72 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.5 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.67 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 236 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.33 
 
 		 234 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  51.65 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  47.43 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.13 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  50.62 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>