More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3000 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  97.27 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  87.16 
 
 		 258 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  68.15 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  64.52 
 
 		 264 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  63.01 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  62.04 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  58.66 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  60.82 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  61.73 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  63.56 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  62.8 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  63.16 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  56.91 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  58.92 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  57.26 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  57.26 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.65 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  54.15 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  55.65 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  56.85 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  56.5 
 
 		 270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  55.43 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 267 aa  284  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  55.6 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  54.77 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  54.77 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  56.85 
 
 		 274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  55.92 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  55.19 
 
 		 269 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  54.77 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  54.33 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 263 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  52.71 
 
 		 279 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  56.02 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.73 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  55.19 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  53.82 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  52.69 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  53.52 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  53.94 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  54.1 
 
 		 276 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  51.81 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  53.94 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  53.47 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  51.82 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  54.13 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  52.19 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 272 aa  255  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  50 
 
 		 281 aa  255  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  53.94 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  52.7 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  52.46 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  52.05 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  48.16 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  51.63 
 
 		 270 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  54.25 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  50.21 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.38 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  52.99 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  51.78 
 
 		 276 aa  231  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.83 
 
 		 235 aa  231  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.17 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 237 aa  228  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.35 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.59 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.13 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.93 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.05 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.98 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.93 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.59 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  44.14 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.55 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  47.95 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 235 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  47.76 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  48.96 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  48.96 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  47.35 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  47.35 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  45.31 
 
 		 286 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.35 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>