More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0564 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  83.27 
 
 
269 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  81.95 
 
 
269 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  82.13 
 
 
269 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  80.75 
 
 
269 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  78.57 
 
 
281 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  80.83 
 
 
274 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  80.38 
 
 
269 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  79.32 
 
 
270 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  79.4 
 
 
270 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  74.44 
 
 
271 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  75.28 
 
 
271 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  73.31 
 
 
291 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  74.07 
 
 
271 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  72.93 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  72.66 
 
 
276 aa  397  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  72.18 
 
 
274 aa  397  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  72.28 
 
 
276 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  72.28 
 
 
276 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  71.8 
 
 
274 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  70.3 
 
 
278 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  71.16 
 
 
276 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  64.26 
 
 
277 aa  359  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  55.89 
 
 
263 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  62.3 
 
 
253 aa  308  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  57.2 
 
 
273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  58.78 
 
 
279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  58.4 
 
 
279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  60.49 
 
 
264 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  57.2 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  57.79 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  57.14 
 
 
263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  57.63 
 
 
279 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  56.44 
 
 
266 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  62.04 
 
 
258 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  57.52 
 
 
281 aa  299  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  55.51 
 
 
263 aa  299  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  57.25 
 
 
279 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  57.25 
 
 
279 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  57.63 
 
 
278 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  57.63 
 
 
280 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  57.74 
 
 
265 aa  298  7e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 
263 aa  297  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.63 
 
 
260 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  55.89 
 
 
263 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 
272 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  56.65 
 
 
273 aa  291  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  54.96 
 
 
272 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  52.85 
 
 
283 aa  289  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  53.56 
 
 
272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  55.06 
 
 
270 aa  288  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  54.28 
 
 
276 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  54.92 
 
 
269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  52.81 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.14 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  57.14 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  56.18 
 
 
272 aa  275  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  54.68 
 
 
276 aa  265  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  53.63 
 
 
254 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  54.29 
 
 
253 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  53.47 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51.87 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
258 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51.22 
 
 
266 aa  244  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  46.42 
 
 
257 aa  238  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.59 
 
 
265 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  48.28 
 
 
258 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
234 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  45.21 
 
 
286 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  50 
 
 
265 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  47.92 
 
 
236 aa  226  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.58 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  49.18 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.75 
 
 
235 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
235 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  48.13 
 
 
241 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  48.13 
 
 
241 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.62 
 
 
237 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  48.96 
 
 
236 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  47.92 
 
 
235 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  47.37 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.38 
 
 
236 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  48.13 
 
 
241 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  45.83 
 
 
236 aa  211  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.33 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.95 
 
 
247 aa  211  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.33 
 
 
234 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  47.13 
 
 
238 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  48.36 
 
 
237 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
237 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 
242 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0760  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
274 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  46.47 
 
 
236 aa  210  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  46.28 
 
 
245 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.52 
 
 
235 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.33 
 
 
234 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>