More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4098 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  100 
 
 		 286 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  82.28 
 
 		 265 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  81.42 
 
 		 257 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  61.38 
 
 		 249 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 		 258 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  52.85 
 
 		 266 aa  254  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  51.15 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  52.99 
 
 		 236 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.99 
 
 		 234 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  50.57 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  47.43 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  48.18 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.18 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  47.79 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  48.28 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  47.53 
 
 		 272 aa  245  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  49.62 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  52.14 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  47.64 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  45.77 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  47.41 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  47.91 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  51.27 
 
 		 235 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.64 
 
 		 239 aa  242  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  53.42 
 
 		 233 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  52.5 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.27 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  48.47 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.57 
 
 		 234 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  46.47 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  47.33 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  48.51 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  51.27 
 
 		 237 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  47.53 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  46.77 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 		 247 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  48.05 
 
 		 247 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  47.71 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  46.1 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.61 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  48.72 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 234 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  51.06 
 
 		 236 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.14 
 
 		 235 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  47.13 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 238 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  53.19 
 
 		 251 aa  235  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  49.17 
 
 		 253 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  43.94 
 
 		 269 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  48.47 
 
 		 270 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  47.62 
 
 		 279 aa  235  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  46.21 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  44.27 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  47.9 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.16 
 
 		 254 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  43.23 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.8 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  45.8 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  47.76 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.85 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  44.83 
 
 		 291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  49.15 
 
 		 254 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.86 
 
 		 237 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  47.76 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  43.68 
 
 		 269 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  46.79 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  52.99 
 
 		 235 aa  232  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  50.84 
 
 		 240 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  49.15 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.34 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  43.68 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  48.32 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.28 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  49.79 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  50.58 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  47.48 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>