More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4180 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  93.19 
 
 		 279 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  93.75 
 
 		 279 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  92.96 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  91.35 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  84.07 
 
 		 278 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  83.52 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  82.29 
 
 		 279 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  79.85 
 
 		 273 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  75.67 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  77.24 
 
 		 281 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  73.43 
 
 		 272 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  73.26 
 
 		 273 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.38 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  66.03 
 
 		 263 aa  352  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  63.88 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  63.12 
 
 		 266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  60 
 
 		 276 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.34 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  61.22 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  59.34 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  61.83 
 
 		 263 aa  332  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  58.63 
 
 		 281 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  61.34 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  60.37 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  58.82 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  61.45 
 
 		 265 aa  325  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  59.7 
 
 		 274 aa  324  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  61.45 
 
 		 269 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  59.41 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  59.4 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  56.83 
 
 		 277 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  59.92 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  59.54 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  59.33 
 
 		 271 aa  318  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  60.82 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  59.16 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  59.16 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  61.6 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  59.33 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  59.32 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  59.32 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  61.36 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  58.4 
 
 		 267 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  58.17 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  59.32 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  57.03 
 
 		 263 aa  309  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  57.41 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  62.74 
 
 		 272 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  55.3 
 
 		 283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 276 aa  301  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  52.71 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  56.38 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.53 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  52.55 
 
 		 258 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.17 
 
 		 234 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  53.04 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 235 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  52.11 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  52.05 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  56.02 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  56.43 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  54.26 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  53.94 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  52.5 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  53.94 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  53.94 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  54.36 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  54.77 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 259 aa  242  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  49.43 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.92 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.31 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  54.55 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.77 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.92 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  54.07 
 
 		 240 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  46.77 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.7 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.74 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.72 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.04 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  52.08 
 
 		 235 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.88 
 
 		 233 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  52.07 
 
 		 239 aa  235  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  51.88 
 
 		 249 aa  234  9e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  52.05 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  53.14 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  55 
 
 		 235 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>