More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0949 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  95.29 
 
 		 276 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  86.96 
 
 		 274 aa  500  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  86.47 
 
 		 274 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  86.57 
 
 		 278 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  83.7 
 
 		 276 aa  474  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  73.68 
 
 		 270 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  73.31 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  72.93 
 
 		 270 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  73.7 
 
 		 271 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  70.33 
 
 		 271 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  72.73 
 
 		 269 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  70.68 
 
 		 269 aa  400  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  73.33 
 
 		 271 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  73.31 
 
 		 267 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  71.54 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  70.68 
 
 		 269 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  69.37 
 
 		 281 aa  394  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  70.48 
 
 		 274 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  70.45 
 
 		 269 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  70.08 
 
 		 277 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  72.28 
 
 		 267 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 263 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  59.34 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  60.53 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  60 
 
 		 263 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  60.53 
 
 		 281 aa  330  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  60.84 
 
 		 279 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  59.63 
 
 		 279 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  59.25 
 
 		 266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  63.11 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  59.62 
 
 		 266 aa  324  9e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  58.39 
 
 		 278 aa  323  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  59.12 
 
 		 280 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  59.7 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.7 
 
 		 260 aa  321  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  56.57 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  57.41 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  58.65 
 
 		 273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  58.46 
 
 		 299 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  57.41 
 
 		 272 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  59.76 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  61.4 
 
 		 272 aa  316  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  58.56 
 
 		 272 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  56.82 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  58.49 
 
 		 269 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  54.51 
 
 		 276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  56.82 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  59.77 
 
 		 265 aa  310  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  56.34 
 
 		 272 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  59.56 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  53.23 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  57.09 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  58.23 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 		 258 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  55.65 
 
 		 258 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.24 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.69 
 
 		 257 aa  284  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  56.45 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  54.58 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  56.43 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.05 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.81 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  49.43 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  48.53 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  48.18 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  49.43 
 
 		 258 aa  244  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.7 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  53.11 
 
 		 235 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  49.8 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  53.31 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.28 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  52.26 
 
 		 236 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.87 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.37 
 
 		 239 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.45 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.26 
 
 		 236 aa  235  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.17 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.04 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.48 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 236 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.07 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  47.77 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.23 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  51.23 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  52.05 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.23 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51.24 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.83 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  50.41 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  50.41 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.5 
 
 		 238 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.47 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  47.58 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>