More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1426 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  63.2 
 
 		 265 aa  329  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  62.04 
 
 		 257 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  61.38 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  55.51 
 
 		 258 aa  274  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  55.08 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.99 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  53.16 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.91 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  53.23 
 
 		 299 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.56 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.14 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  51.46 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.32 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.88 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  52.24 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  53.91 
 
 		 279 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  52.92 
 
 		 242 aa  251  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50.62 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  51.9 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 272 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.49 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  52.56 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.26 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  248  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  52.05 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  51.49 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  53.53 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  51.28 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.14 
 
 		 239 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  51.81 
 
 		 279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  52.1 
 
 		 264 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  52.5 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  51.28 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  52.96 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  51.19 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.56 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.69 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.28 
 
 		 239 aa  242  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  49.37 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  49.6 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  50 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.57 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.74 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.71 
 
 		 244 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  51.44 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.29 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  49.6 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.14 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  47.92 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  50.63 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  49.2 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.7 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.85 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  51.49 
 
 		 237 aa  238  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.71 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  45.15 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  49.15 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  51.71 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  48.31 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  51.03 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.94 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>