More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1863 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  56.9 
 
 
245 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  57.32 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  56.3 
 
 
242 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  55.93 
 
 
237 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  56.6 
 
 
251 aa  262  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  55.08 
 
 
237 aa  259  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  50.85 
 
 
236 aa  248  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
259 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  51.49 
 
 
235 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 
234 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  52.99 
 
 
234 aa  244  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  52.99 
 
 
234 aa  244  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  51.71 
 
 
235 aa  244  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.71 
 
 
235 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.77 
 
 
235 aa  241  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 
234 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  50.21 
 
 
249 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  51.91 
 
 
234 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  53.42 
 
 
234 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.71 
 
 
236 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.14 
 
 
236 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
256 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  51.28 
 
 
242 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 
234 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  52.77 
 
 
233 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.28 
 
 
245 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  52.14 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  51.27 
 
 
237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  50.21 
 
 
257 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  52.12 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.79 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.14 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  50.85 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  50.64 
 
 
247 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.71 
 
 
239 aa  233  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  49.58 
 
 
234 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  49.79 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  52.56 
 
 
234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
237 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  51.71 
 
 
233 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  49.57 
 
 
234 aa  231  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  49.57 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
253 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  53.19 
 
 
234 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.28 
 
 
239 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  48.94 
 
 
239 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.91 
 
 
238 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.14 
 
 
233 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
233 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  49.58 
 
 
238 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  51.28 
 
 
233 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  48.71 
 
 
240 aa  229  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  48.72 
 
 
234 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.27 
 
 
234 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 
233 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.15 
 
 
236 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  49.57 
 
 
233 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  50.21 
 
 
246 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 
234 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
236 aa  228  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.28 
 
 
234 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  50.42 
 
 
238 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  49.57 
 
 
234 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  52.14 
 
 
234 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  49.79 
 
 
247 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  49.79 
 
 
247 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  50.63 
 
 
241 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  50.85 
 
 
233 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.28 
 
 
233 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  51.71 
 
 
234 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  52.56 
 
 
234 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50.85 
 
 
236 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.21 
 
 
237 aa  227  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  49.79 
 
 
247 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 
233 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  48.51 
 
 
265 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  50.85 
 
 
233 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  52.56 
 
 
234 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  50.85 
 
 
233 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.29 
 
 
236 aa  226  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  51.69 
 
 
237 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.64 
 
 
235 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
233 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 
234 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.72 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.86 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  50.85 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  50.85 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  50.85 
 
 
233 aa  224  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  48.73 
 
 
238 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  49.79 
 
 
237 aa  224  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  224  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  49.79 
 
 
237 aa  224  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  50 
 
 
233 aa  224  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.29 
 
 
251 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>